如果给你一段DNA序列,(1)你能快速分析出其翻译后对应的氨基酸序列吗?(2)怎么快速的做出高颜值的DNA-蛋白质翻译序列对照图?原以为有一键式懒人神器,但折腾了好久也没发现。所以在这期内容中,我给大家分享一下我个人摸索路上的一点经验(先展示一下结果)。如果你有更好的建议,欢迎一起交流学习。
工具/原料
- ExPASy-translate tool
- Word(Powerpoint、AI后期可选)
方法/步骤
获得用于蛋白质翻译的DNA模板序列,找到并选择CDS区(第一个ATG即是翻译的起始密码子)。
在浏览器中打开ExPASy-translate tool页面(如下图)。
按照如下图1、2、3、4、5步骤粘贴模板DNA序列,勾选相应参数,点击TRANSLATE。
生成示例结果如下图,开放读码框(即蛋白质翻译区)被标记为红色。
点击结果页右侧Download all thhe translated frames(如下),下载.txt结果到本地。同时打开word。
复制.txt文本中相应区域比对序列至word文档,可以看见此时DNA和蛋白质序列之间尚有错位。
选中全部序列,调整(1)对齐方式为“分散对齐”;(2)字体为Time New Roman或Consolas;(3)字号大小。可以看出排版已经非常接近展示结果。
最后再根据突变特征或个人偏好导入Powerpoin或AI适当调整细节,即是发表级作品。
END
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